Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKMT2P17540 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms