Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA1P17302 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJA1P17302 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJA1P17302 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJA1P17302 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJA1P17302 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJA1P17302 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJA1P17302 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA1P17302 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA1P17302 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA1P17302 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA1P17302 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA1P17302 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA1P17302 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA1P17302 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA1P17302 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA1P17302 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA1P17302 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA1P17302 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA1P17302 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA1P17302 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA1P17302 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA1P17302 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA1P17302 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJA1P17302 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA1P17302 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA1P17302 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA1P17302 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJA1P17302 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA1P17302 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA1P17302 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA1P17302 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA1P17302 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA1P17302 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA1P17302 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA1P17302 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA1P17302 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA1P17302 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJA1P17302 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA1P17302 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GJA1P17302 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA1P17302 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA1P17302 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA1P17302 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA1P17302 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA1P17302 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA1P17302 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA1P17302 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA1P17302 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA1P17302 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA1P17302 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA1P17302 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA1P17302 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA1P17302 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA1P17302 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA1P17302 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA1P17302 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA1P17302 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA1P17302 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA1P17302 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA1P17302 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA1P17302 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA1P17302 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA1P17302 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA1P17302 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA1P17302 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA1P17302 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA1P17302 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA1P17302 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA1P17302 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA1P17302 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA1P17302 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA1P17302 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA1P17302 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA1P17302 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA1P17302 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA1P17302 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA1P17302 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA1P17302 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA1P17302 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA1P17302 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA1P17302 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA1P17302 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA1P17302 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA1P17302 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA1P17302 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA1P17302 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA1P17302 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA1P17302 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA1P17302 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA1P17302 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA1P17302 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA1P17302 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA1P17302 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA1P17302 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA1P17302 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA1P17302 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA1P17302 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA1P17302 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA1P17302 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms