Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPGDP15428 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HPGDP15428 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPGDP15428 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPGDP15428 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPGDP15428 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPGDP15428 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPGDP15428 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPGDP15428 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPGDP15428 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPGDP15428 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPGDP15428 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPGDP15428 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPGDP15428 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPGDP15428 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPGDP15428 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPGDP15428 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPGDP15428 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPGDP15428 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPGDP15428 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HPGDP15428 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPGDP15428 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPGDP15428 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPGDP15428 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPGDP15428 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPGDP15428 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPGDP15428 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HPGDP15428 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPGDP15428 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPGDP15428 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPGDP15428 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPGDP15428 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPGDP15428 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPGDP15428 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HPGDP15428 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPGDP15428 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HPGDP15428 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPGDP15428 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPGDP15428 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPGDP15428 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPGDP15428 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPGDP15428 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPGDP15428 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPGDP15428 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HPGDP15428 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPGDP15428 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPGDP15428 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPGDP15428 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HPGDP15428 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPGDP15428 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPGDP15428 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPGDP15428 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPGDP15428 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPGDP15428 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPGDP15428 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPGDP15428 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPGDP15428 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPGDP15428 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPGDP15428 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPGDP15428 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPGDP15428 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPGDP15428 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPGDP15428 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPGDP15428 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPGDP15428 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPGDP15428 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPGDP15428 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPGDP15428 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPGDP15428 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPGDP15428 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPGDP15428 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPGDP15428 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPGDP15428 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPGDP15428 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPGDP15428 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HPGDP15428 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPGDP15428 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPGDP15428 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPGDP15428 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPGDP15428 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPGDP15428 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPGDP15428 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HPGDP15428 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPGDP15428 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPGDP15428 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPGDP15428 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPGDP15428 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPGDP15428 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPGDP15428 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPGDP15428 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPGDP15428 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPGDP15428 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPGDP15428 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPGDP15428 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HPGDP15428 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPGDP15428 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HPGDP15428 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPGDP15428 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPGDP15428 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPGDP15428 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms