Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GSPT1P15170 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
GSPT1P15170 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GSPT1P15170 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GSPT1P15170 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GSPT1P15170 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GSPT1P15170 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GSPT1P15170 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GSPT1P15170 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GSPT1P15170 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GSPT1P15170 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GSPT1P15170 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GSPT1P15170 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GSPT1P15170 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GSPT1P15170 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GSPT1P15170 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GSPT1P15170 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GSPT1P15170 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GSPT1P15170 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GSPT1P15170 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GSPT1P15170 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GSPT1P15170 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GSPT1P15170 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GSPT1P15170 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
GSPT1P15170 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
GSPT1P15170 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GSPT1P15170 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GSPT1P15170 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms