Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEPDP12955 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PEPDP12955 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PEPDP12955 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEPDP12955 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEPDP12955 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEPDP12955 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEPDP12955 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEPDP12955 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEPDP12955 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEPDP12955 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEPDP12955 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEPDP12955 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEPDP12955 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEPDP12955 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEPDP12955 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEPDP12955 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PEPDP12955 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEPDP12955 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEPDP12955 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEPDP12955 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEPDP12955 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEPDP12955 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PEPDP12955 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEPDP12955 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEPDP12955 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEPDP12955 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEPDP12955 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEPDP12955 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEPDP12955 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEPDP12955 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEPDP12955 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEPDP12955 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEPDP12955 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEPDP12955 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEPDP12955 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEPDP12955 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEPDP12955 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEPDP12955 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEPDP12955 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEPDP12955 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEPDP12955 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEPDP12955 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEPDP12955 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEPDP12955 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEPDP12955 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEPDP12955 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEPDP12955 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEPDP12955 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEPDP12955 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEPDP12955 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEPDP12955 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEPDP12955 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEPDP12955 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEPDP12955 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEPDP12955 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEPDP12955 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEPDP12955 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEPDP12955 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEPDP12955 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PEPDP12955 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PEPDP12955 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEPDP12955 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEPDP12955 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEPDP12955 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEPDP12955 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEPDP12955 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEPDP12955 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEPDP12955 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PEPDP12955 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEPDP12955 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEPDP12955 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEPDP12955 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEPDP12955 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEPDP12955 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEPDP12955 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PEPDP12955 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEPDP12955 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEPDP12955 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEPDP12955 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEPDP12955 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEPDP12955 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEPDP12955 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEPDP12955 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEPDP12955 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEPDP12955 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEPDP12955 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEPDP12955 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEPDP12955 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEPDP12955 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEPDP12955 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEPDP12955 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEPDP12955 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEPDP12955 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEPDP12955 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEPDP12955 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEPDP12955 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEPDP12955 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEPDP12955 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEPDP12955 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms