Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HARSP12081 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HARSP12081 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HARSP12081 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HARSP12081 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HARSP12081 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HARSP12081 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HARSP12081 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HARSP12081 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HARSP12081 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HARSP12081 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HARSP12081 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HARSP12081 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HARSP12081 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HARSP12081 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HARSP12081 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HARSP12081 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HARSP12081 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HARSP12081 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HARSP12081 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HARSP12081 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HARSP12081 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HARSP12081 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HARSP12081 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HARSP12081 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HARSP12081 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HARSP12081 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HARSP12081 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HARSP12081 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HARSP12081 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HARSP12081 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HARSP12081 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HARSP12081 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HARSP12081 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HARSP12081 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HARSP12081 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HARSP12081 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HARSP12081 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HARSP12081 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HARSP12081 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HARSP12081 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HARSP12081 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HARSP12081 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HARSP12081 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HARSP12081 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HARSP12081 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HARSP12081 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HARSP12081 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HARSP12081 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HARSP12081 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HARSP12081 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HARSP12081 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HARSP12081 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HARSP12081 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HARSP12081 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HARSP12081 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HARSP12081 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HARSP12081 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HARSP12081 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HARSP12081 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HARSP12081 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HARSP12081 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HARSP12081 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HARSP12081 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HARSP12081 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HARSP12081 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HARSP12081 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HARSP12081 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HARSP12081 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HARSP12081 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HARSP12081 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HARSP12081 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HARSP12081 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HARSP12081 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HARSP12081 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HARSP12081 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HARSP12081 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HARSP12081 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HARSP12081 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HARSP12081 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HARSP12081 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HARSP12081 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HARSP12081 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HARSP12081 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HARSP12081 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HARSP12081 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HARSP12081 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HARSP12081 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HARSP12081 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HARSP12081 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HARSP12081 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HARSP12081 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HARSP12081 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HARSP12081 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HARSP12081 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HARSP12081 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HARSP12081 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HARSP12081 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HARSP12081 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HARSP12081 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms