Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GIMD1P0DJR0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GIMD1P0DJR0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GIMD1P0DJR0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIMD1P0DJR0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIMD1P0DJR0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIMD1P0DJR0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GIMD1P0DJR0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIMD1P0DJR0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GIMD1P0DJR0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIMD1P0DJR0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GIMD1P0DJR0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIMD1P0DJR0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GIMD1P0DJR0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms