Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC166P0CW27 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC166P0CW27 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC166P0CW27 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms