Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM200BP0CF97 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM200BP0CF97 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM200BP0CF97 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM200BP0CF97 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM200BP0CF97 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM200BP0CF97 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM200BP0CF97 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM200BP0CF97 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
FAM200BP0CF97 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM200BP0CF97 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms