Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR2MP0CAP2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR2MP0CAP2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2MP0CAP2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2MP0CAP2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2MP0CAP2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2MP0CAP2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2MP0CAP2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR2MP0CAP2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR2MP0CAP2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR2MP0CAP2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR2MP0CAP2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR2MP0CAP2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR2MP0CAP2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR2MP0CAP2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR2MP0CAP2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLR2MP0CAP2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLR2MP0CAP2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLR2MP0CAP2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR2MP0CAP2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms