Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V6

SUPT20HL2, Putative transcription factor SPT20 homolog-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT20HL2P0C7V6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUPT20HL2P0C7V6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUPT20HL2P0C7V6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SUPT20HL2P0C7V6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUPT20HL2P0C7V6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SUPT20HL2P0C7V6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SUPT20HL2P0C7V6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SUPT20HL2P0C7V6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms