Protein–RNA interactions for Protein: P07205

PGK2, Phosphoglycerate kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGK2P07205 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PGK2P07205 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PGK2P07205 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PGK2P07205 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PGK2P07205 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGK2P07205 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGK2P07205 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGK2P07205 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGK2P07205 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGK2P07205 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGK2P07205 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGK2P07205 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGK2P07205 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGK2P07205 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PGK2P07205 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGK2P07205 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGK2P07205 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGK2P07205 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGK2P07205 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGK2P07205 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGK2P07205 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGK2P07205 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PGK2P07205 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PGK2P07205 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PGK2P07205 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PGK2P07205 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PGK2P07205 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PGK2P07205 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PGK2P07205 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PGK2P07205 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGK2P07205 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGK2P07205 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGK2P07205 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGK2P07205 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGK2P07205 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PGK2P07205 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGK2P07205 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGK2P07205 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGK2P07205 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGK2P07205 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PGK2P07205 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PGK2P07205 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PGK2P07205 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PGK2P07205 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PGK2P07205 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PGK2P07205 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PGK2P07205 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PGK2P07205 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PGK2P07205 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PGK2P07205 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PGK2P07205 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGK2P07205 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGK2P07205 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGK2P07205 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGK2P07205 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGK2P07205 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGK2P07205 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGK2P07205 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGK2P07205 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PGK2P07205 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PGK2P07205 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PGK2P07205 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PGK2P07205 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PGK2P07205 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PGK2P07205 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PGK2P07205 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGK2P07205 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGK2P07205 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGK2P07205 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGK2P07205 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGK2P07205 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGK2P07205 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGK2P07205 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGK2P07205 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGK2P07205 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGK2P07205 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PGK2P07205 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PGK2P07205 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PGK2P07205 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PGK2P07205 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PGK2P07205 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PGK2P07205 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PGK2P07205 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PGK2P07205 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGK2P07205 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGK2P07205 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PGK2P07205 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGK2P07205 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGK2P07205 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGK2P07205 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGK2P07205 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGK2P07205 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGK2P07205 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PGK2P07205 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PGK2P07205 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PGK2P07205 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PGK2P07205 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PGK2P07205 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PGK2P07205 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PGK2P07205 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms