Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCGP05129 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKCGP05129 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCGP05129 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKCGP05129 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms