Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A1P02730 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC4A1P02730 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A1P02730 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.7 ms