Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX11BO96011 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX11BO96011 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms