Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
DDX58O95786 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
DDX58O95786 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
DDX58O95786 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
DDX58O95786 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
DDX58O95786 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDX58O95786 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDX58O95786 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDX58O95786 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDX58O95786 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDX58O95786 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDX58O95786 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDX58O95786 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDX58O95786 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
DDX58O95786 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
DDX58O95786 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
DDX58O95786 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
DDX58O95786 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
DDX58O95786 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
DDX58O95786 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
DDX58O95786 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
DDX58O95786 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
DDX58O95786 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
DDX58O95786 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
DDX58O95786 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
DDX58O95786 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
DDX58O95786 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
DDX58O95786 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
DDX58O95786 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
DDX58O95786 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDX58O95786 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDX58O95786 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDX58O95786 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDX58O95786 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDX58O95786 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDX58O95786 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDX58O95786 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
DDX58O95786 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
DDX58O95786 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DDX58O95786 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DDX58O95786 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
DDX58O95786 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
DDX58O95786 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
DDX58O95786 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
DDX58O95786 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
DDX58O95786 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
DDX58O95786 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
DDX58O95786 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
DDX58O95786 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
DDX58O95786 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
DDX58O95786 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DDX58O95786 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
DDX58O95786 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DDX58O95786 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DDX58O95786 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DDX58O95786 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
DDX58O95786 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
DDX58O95786 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
DDX58O95786 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
DDX58O95786 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DDX58O95786 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DDX58O95786 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
DDX58O95786 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDX58O95786 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDX58O95786 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDX58O95786 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDX58O95786 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDX58O95786 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDX58O95786 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DDX58O95786 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
DDX58O95786 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
DDX58O95786 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
DDX58O95786 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
DDX58O95786 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DDX58O95786 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DDX58O95786 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDX58O95786 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDX58O95786 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DDX58O95786 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DDX58O95786 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DDX58O95786 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DDX58O95786 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DDX58O95786 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DDX58O95786 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DDX58O95786 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DDX58O95786 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DDX58O95786 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
DDX58O95786 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DDX58O95786 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DDX58O95786 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DDX58O95786 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DDX58O95786 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DDX58O95786 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDX58O95786 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDX58O95786 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
DDX58O95786 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDX58O95786 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDX58O95786 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDX58O95786 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDX58O95786 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms