Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF12O95522 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF12O95522 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF12O95522 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms