Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX6O95503 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX6O95503 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX6O95503 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX6O95503 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX6O95503 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX6O95503 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX6O95503 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX6O95503 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX6O95503 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX6O95503 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX6O95503 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX6O95503 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX6O95503 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX6O95503 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX6O95503 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX6O95503 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX6O95503 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX6O95503 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX6O95503 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX6O95503 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBX6O95503 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX6O95503 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX6O95503 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX6O95503 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX6O95503 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX6O95503 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX6O95503 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX6O95503 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBX6O95503 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CBX6O95503 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CBX6O95503 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBX6O95503 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBX6O95503 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBX6O95503 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBX6O95503 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX6O95503 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX6O95503 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX6O95503 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX6O95503 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CBX6O95503 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX6O95503 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX6O95503 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX6O95503 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX6O95503 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX6O95503 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX6O95503 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX6O95503 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX6O95503 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX6O95503 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX6O95503 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBX6O95503 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX6O95503 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX6O95503 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX6O95503 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX6O95503 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBX6O95503 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX6O95503 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX6O95503 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX6O95503 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX6O95503 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBX6O95503 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX6O95503 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBX6O95503 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX6O95503 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX6O95503 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX6O95503 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX6O95503 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX6O95503 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBX6O95503 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CBX6O95503 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBX6O95503 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBX6O95503 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBX6O95503 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CBX6O95503 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBX6O95503 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBX6O95503 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBX6O95503 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBX6O95503 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBX6O95503 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBX6O95503 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBX6O95503 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBX6O95503 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBX6O95503 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBX6O95503 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CBX6O95503 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBX6O95503 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CBX6O95503 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CBX6O95503 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CBX6O95503 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CBX6O95503 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CBX6O95503 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX6O95503 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX6O95503 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX6O95503 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX6O95503 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX6O95503 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX6O95503 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX6O95503 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX6O95503 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms