Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNGR4O95473 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNGR4O95473 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms