Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF6BO95407 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF6BO95407 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF6BO95407 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF6BO95407 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF6BO95407 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF6BO95407 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF6BO95407 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF6BO95407 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF6BO95407 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF6BO95407 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF6BO95407 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF6BO95407 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF6BO95407 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF6BO95407 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF6BO95407 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TNFRSF6BO95407 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF6BO95407 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms