Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB5O95377 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB5O95377 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB5O95377 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB5O95377 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB5O95377 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB5O95377 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJB5O95377 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJB5O95377 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB5O95377 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB5O95377 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GJB5O95377 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB5O95377 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB5O95377 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB5O95377 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB5O95377 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJB5O95377 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJB5O95377 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJB5O95377 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GJB5O95377 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJB5O95377 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJB5O95377 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB5O95377 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB5O95377 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB5O95377 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB5O95377 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJB5O95377 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB5O95377 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB5O95377 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB5O95377 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB5O95377 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB5O95377 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJB5O95377 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB5O95377 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB5O95377 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB5O95377 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB5O95377 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJB5O95377 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GJB5O95377 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB5O95377 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB5O95377 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB5O95377 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB5O95377 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB5O95377 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJB5O95377 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB5O95377 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB5O95377 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJB5O95377 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB5O95377 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB5O95377 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB5O95377 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJB5O95377 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJB5O95377 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJB5O95377 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB5O95377 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB5O95377 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB5O95377 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB5O95377 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJB5O95377 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB5O95377 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB5O95377 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB5O95377 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB5O95377 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB5O95377 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB5O95377 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB5O95377 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB5O95377 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB5O95377 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB5O95377 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJB5O95377 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB5O95377 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB5O95377 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB5O95377 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB5O95377 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB5O95377 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJB5O95377 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB5O95377 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB5O95377 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB5O95377 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB5O95377 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB5O95377 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJB5O95377 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB5O95377 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB5O95377 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB5O95377 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJB5O95377 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB5O95377 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB5O95377 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB5O95377 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB5O95377 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB5O95377 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB5O95377 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJB5O95377 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB5O95377 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB5O95377 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB5O95377 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB5O95377 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJB5O95377 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB5O95377 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJB5O95377 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms