Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLSTN1O94985 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLSTN1O94985 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLSTN1O94985 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSTN1O94985 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSTN1O94985 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSTN1O94985 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSTN1O94985 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSTN1O94985 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSTN1O94985 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLSTN1O94985 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSTN1O94985 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSTN1O94985 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSTN1O94985 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLSTN1O94985 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSTN1O94985 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSTN1O94985 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSTN1O94985 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSTN1O94985 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSTN1O94985 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSTN1O94985 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSTN1O94985 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSTN1O94985 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSTN1O94985 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSTN1O94985 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSTN1O94985 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSTN1O94985 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms