Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DKK1O94907 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DKK1O94907 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DKK1O94907 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DKK1O94907 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DKK1O94907 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKK1O94907 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DKK1O94907 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKK1O94907 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKK1O94907 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKK1O94907 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DKK1O94907 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DKK1O94907 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DKK1O94907 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DKK1O94907 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DKK1O94907 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DKK1O94907 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DKK1O94907 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK1O94907 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK1O94907 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK1O94907 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK1O94907 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK1O94907 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK1O94907 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK1O94907 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK1O94907 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK1O94907 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DKK1O94907 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DKK1O94907 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DKK1O94907 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DKK1O94907 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DKK1O94907 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DKK1O94907 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DKK1O94907 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DKK1O94907 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DKK1O94907 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DKK1O94907 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DKK1O94907 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DKK1O94907 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DKK1O94907 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DKK1O94907 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK1O94907 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK1O94907 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK1O94907 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK1O94907 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK1O94907 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK1O94907 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK1O94907 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK1O94907 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK1O94907 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK1O94907 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DKK1O94907 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DKK1O94907 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DKK1O94907 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DKK1O94907 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DKK1O94907 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DKK1O94907 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DKK1O94907 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DKK1O94907 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DKK1O94907 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DKK1O94907 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DKK1O94907 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DKK1O94907 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DKK1O94907 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DKK1O94907 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DKK1O94907 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DKK1O94907 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DKK1O94907 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DKK1O94907 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DKK1O94907 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DKK1O94907 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKK1O94907 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKK1O94907 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DKK1O94907 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKK1O94907 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKK1O94907 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKK1O94907 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKK1O94907 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKK1O94907 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DKK1O94907 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DKK1O94907 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DKK1O94907 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DKK1O94907 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DKK1O94907 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DKK1O94907 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DKK1O94907 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DKK1O94907 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DKK1O94907 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DKK1O94907 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DKK1O94907 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DKK1O94907 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DKK1O94907 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DKK1O94907 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DKK1O94907 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DKK1O94907 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DKK1O94907 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DKK1O94907 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DKK1O94907 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DKK1O94907 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DKK1O94907 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms