Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB3O75712 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB3O75712 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB3O75712 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB3O75712 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB3O75712 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB3O75712 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB3O75712 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB3O75712 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB3O75712 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB3O75712 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB3O75712 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB3O75712 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB3O75712 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB3O75712 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB3O75712 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB3O75712 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB3O75712 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB3O75712 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB3O75712 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB3O75712 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB3O75712 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB3O75712 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB3O75712 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB3O75712 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB3O75712 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB3O75712 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB3O75712 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB3O75712 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB3O75712 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB3O75712 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GJB3O75712 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB3O75712 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB3O75712 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB3O75712 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB3O75712 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB3O75712 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB3O75712 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB3O75712 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB3O75712 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB3O75712 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB3O75712 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB3O75712 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB3O75712 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB3O75712 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB3O75712 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB3O75712 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB3O75712 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB3O75712 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB3O75712 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB3O75712 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB3O75712 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB3O75712 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB3O75712 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB3O75712 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB3O75712 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB3O75712 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB3O75712 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB3O75712 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB3O75712 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB3O75712 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB3O75712 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB3O75712 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB3O75712 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB3O75712 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB3O75712 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB3O75712 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB3O75712 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB3O75712 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB3O75712 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB3O75712 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB3O75712 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJB3O75712 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJB3O75712 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJB3O75712 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB3O75712 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB3O75712 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB3O75712 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB3O75712 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB3O75712 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB3O75712 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB3O75712 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB3O75712 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB3O75712 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB3O75712 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB3O75712 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB3O75712 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB3O75712 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB3O75712 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GJB3O75712 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB3O75712 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB3O75712 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB3O75712 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB3O75712 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB3O75712 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJB3O75712 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB3O75712 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB3O75712 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB3O75712 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJB3O75712 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms