Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP9AO75110 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP9AO75110 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP9AO75110 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP9AO75110 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP9AO75110 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP9AO75110 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP9AO75110 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP9AO75110 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP9AO75110 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP9AO75110 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP9AO75110 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP9AO75110 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP9AO75110 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP9AO75110 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms