Protein–RNA interactions for Protein: O60565

GREM1, Gremlin-1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREM1O60565 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GREM1O60565 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GREM1O60565 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GREM1O60565 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GREM1O60565 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GREM1O60565 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GREM1O60565 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GREM1O60565 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GREM1O60565 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GREM1O60565 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GREM1O60565 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GREM1O60565 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GREM1O60565 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GREM1O60565 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GREM1O60565 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GREM1O60565 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GREM1O60565 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GREM1O60565 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GREM1O60565 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GREM1O60565 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GREM1O60565 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GREM1O60565 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GREM1O60565 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GREM1O60565 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GREM1O60565 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GREM1O60565 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GREM1O60565 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GREM1O60565 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GREM1O60565 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GREM1O60565 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GREM1O60565 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GREM1O60565 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GREM1O60565 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GREM1O60565 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GREM1O60565 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GREM1O60565 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GREM1O60565 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GREM1O60565 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GREM1O60565 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GREM1O60565 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GREM1O60565 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GREM1O60565 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GREM1O60565 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GREM1O60565 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GREM1O60565 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GREM1O60565 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GREM1O60565 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GREM1O60565 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GREM1O60565 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GREM1O60565 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GREM1O60565 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GREM1O60565 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GREM1O60565 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GREM1O60565 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GREM1O60565 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GREM1O60565 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GREM1O60565 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GREM1O60565 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GREM1O60565 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GREM1O60565 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GREM1O60565 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GREM1O60565 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GREM1O60565 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GREM1O60565 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GREM1O60565 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GREM1O60565 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GREM1O60565 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GREM1O60565 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GREM1O60565 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GREM1O60565 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GREM1O60565 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GREM1O60565 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GREM1O60565 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GREM1O60565 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GREM1O60565 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GREM1O60565 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GREM1O60565 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GREM1O60565 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GREM1O60565 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GREM1O60565 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GREM1O60565 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GREM1O60565 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GREM1O60565 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GREM1O60565 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GREM1O60565 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GREM1O60565 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GREM1O60565 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GREM1O60565 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GREM1O60565 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GREM1O60565 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GREM1O60565 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GREM1O60565 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GREM1O60565 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GREM1O60565 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GREM1O60565 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GREM1O60565 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GREM1O60565 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GREM1O60565 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GREM1O60565 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GREM1O60565 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms