Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.84
KIAA0556O60303 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
KIAA0556O60303 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
KIAA0556O60303 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
KIAA0556O60303 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
KIAA0556O60303 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
KIAA0556O60303 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
KIAA0556O60303 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
KIAA0556O60303 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
KIAA0556O60303 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
KIAA0556O60303 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
KIAA0556O60303 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
KIAA0556O60303 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
KIAA0556O60303 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
KIAA0556O60303 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
KIAA0556O60303 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
KIAA0556O60303 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
KIAA0556O60303 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
KIAA0556O60303 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
KIAA0556O60303 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC39■■■■□ 3.83
KIAA0556O60303 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
KIAA0556O60303 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
KIAA0556O60303 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
KIAA0556O60303 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
KIAA0556O60303 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
KIAA0556O60303 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
KIAA0556O60303 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
KIAA0556O60303 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
KIAA0556O60303 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
KIAA0556O60303 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
KIAA0556O60303 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
KIAA0556O60303 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
KIAA0556O60303 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
KIAA0556O60303 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC38.97■■■■□ 3.83
KIAA0556O60303 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
KIAA0556O60303 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
KIAA0556O60303 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
KIAA0556O60303 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
KIAA0556O60303 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
KIAA0556O60303 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
KIAA0556O60303 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
KIAA0556O60303 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
KIAA0556O60303 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
KIAA0556O60303 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
KIAA0556O60303 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
KIAA0556O60303 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
KIAA0556O60303 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
KIAA0556O60303 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
KIAA0556O60303 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
KIAA0556O60303 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
KIAA0556O60303 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
KIAA0556O60303 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
KIAA0556O60303 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
KIAA0556O60303 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
KIAA0556O60303 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
KIAA0556O60303 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
KIAA0556O60303 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
KIAA0556O60303 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
KIAA0556O60303 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
KIAA0556O60303 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
KIAA0556O60303 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
KIAA0556O60303 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
KIAA0556O60303 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC38.89■■■■□ 3.82
KIAA0556O60303 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
KIAA0556O60303 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC38.88■■■■□ 3.81
KIAA0556O60303 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
KIAA0556O60303 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
KIAA0556O60303 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
KIAA0556O60303 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
KIAA0556O60303 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
KIAA0556O60303 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
KIAA0556O60303 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
KIAA0556O60303 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
KIAA0556O60303 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
KIAA0556O60303 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
KIAA0556O60303 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC38.85■■■■□ 3.81
KIAA0556O60303 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
KIAA0556O60303 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
KIAA0556O60303 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
KIAA0556O60303 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
KIAA0556O60303 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
KIAA0556O60303 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
KIAA0556O60303 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
KIAA0556O60303 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
KIAA0556O60303 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
KIAA0556O60303 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
KIAA0556O60303 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
KIAA0556O60303 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
KIAA0556O60303 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
KIAA0556O60303 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
KIAA0556O60303 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
KIAA0556O60303 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
KIAA0556O60303 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
KIAA0556O60303 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
KIAA0556O60303 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC38.78■■■■□ 3.8
KIAA0556O60303 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
KIAA0556O60303 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
KIAA0556O60303 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
KIAA0556O60303 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
KIAA0556O60303 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms