Protein–RNA interactions for Protein: O60287

URB1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB1O60287 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
URB1O60287 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
URB1O60287 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
URB1O60287 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
URB1O60287 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
URB1O60287 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
URB1O60287 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
URB1O60287 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
URB1O60287 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
URB1O60287 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
URB1O60287 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
URB1O60287 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
URB1O60287 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
URB1O60287 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
URB1O60287 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
URB1O60287 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
URB1O60287 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
URB1O60287 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
URB1O60287 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
URB1O60287 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
URB1O60287 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
URB1O60287 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
URB1O60287 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
URB1O60287 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
URB1O60287 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
URB1O60287 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
URB1O60287 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
URB1O60287 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
URB1O60287 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
URB1O60287 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
URB1O60287 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
URB1O60287 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
URB1O60287 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
URB1O60287 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
URB1O60287 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
URB1O60287 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
URB1O60287 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
URB1O60287 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
URB1O60287 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
URB1O60287 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
URB1O60287 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
URB1O60287 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
URB1O60287 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
URB1O60287 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
URB1O60287 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
URB1O60287 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
URB1O60287 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
URB1O60287 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
URB1O60287 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
URB1O60287 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
URB1O60287 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
URB1O60287 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
URB1O60287 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
URB1O60287 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
URB1O60287 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
URB1O60287 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
URB1O60287 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
URB1O60287 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
URB1O60287 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
URB1O60287 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
URB1O60287 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
URB1O60287 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
URB1O60287 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
URB1O60287 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
URB1O60287 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
URB1O60287 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
URB1O60287 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
URB1O60287 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
URB1O60287 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
URB1O60287 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
URB1O60287 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
URB1O60287 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
URB1O60287 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
URB1O60287 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
URB1O60287 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
URB1O60287 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
URB1O60287 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
URB1O60287 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
URB1O60287 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
URB1O60287 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
URB1O60287 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
URB1O60287 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
URB1O60287 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
URB1O60287 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
URB1O60287 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
URB1O60287 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
URB1O60287 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
URB1O60287 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
URB1O60287 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
URB1O60287 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
URB1O60287 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
URB1O60287 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
URB1O60287 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
URB1O60287 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
URB1O60287 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
URB1O60287 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
URB1O60287 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
URB1O60287 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
URB1O60287 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
URB1O60287 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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