Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAD21O60216 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAD21O60216 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAD21O60216 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD21O60216 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD21O60216 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD21O60216 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD21O60216 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD21O60216 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD21O60216 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD21O60216 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD21O60216 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD21O60216 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD21O60216 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAD21O60216 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD21O60216 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD21O60216 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD21O60216 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAD21O60216 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD21O60216 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD21O60216 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD21O60216 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAD21O60216 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD21O60216 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD21O60216 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD21O60216 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD21O60216 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAD21O60216 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD21O60216 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD21O60216 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD21O60216 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAD21O60216 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD21O60216 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD21O60216 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD21O60216 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD21O60216 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD21O60216 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RAD21O60216 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD21O60216 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD21O60216 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD21O60216 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAD21O60216 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD21O60216 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD21O60216 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD21O60216 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD21O60216 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD21O60216 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD21O60216 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD21O60216 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD21O60216 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD21O60216 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD21O60216 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD21O60216 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD21O60216 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD21O60216 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD21O60216 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD21O60216 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD21O60216 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD21O60216 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD21O60216 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD21O60216 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD21O60216 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD21O60216 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD21O60216 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD21O60216 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD21O60216 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD21O60216 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD21O60216 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RAD21O60216 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD21O60216 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD21O60216 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD21O60216 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD21O60216 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD21O60216 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAD21O60216 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAD21O60216 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAD21O60216 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAD21O60216 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAD21O60216 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAD21O60216 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAD21O60216 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RAD21O60216 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAD21O60216 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RAD21O60216 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAD21O60216 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD21O60216 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD21O60216 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD21O60216 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD21O60216 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAD21O60216 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RAD21O60216 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAD21O60216 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAD21O60216 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAD21O60216 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAD21O60216 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAD21O60216 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAD21O60216 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAD21O60216 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAD21O60216 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAD21O60216 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms