Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VEGFDO43915 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFDO43915 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VEGFDO43915 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms