Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRICKLE3O43900 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRICKLE3O43900 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRICKLE3O43900 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRICKLE3O43900 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms