Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN6O43657 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSPAN6O43657 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN6O43657 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN6O43657 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms