Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPRY3O43610 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPRY3O43610 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SPRY3O43610 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SPRY3O43610 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SPRY3O43610 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPRY3O43610 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPRY3O43610 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPRY3O43610 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPRY3O43610 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms