Protein–RNA interactions for Protein: O43561

LAT, Linker for activation of T-cells family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATO43561 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LATO43561 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LATO43561 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LATO43561 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LATO43561 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LATO43561 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LATO43561 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LATO43561 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LATO43561 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LATO43561 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LATO43561 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LATO43561 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LATO43561 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LATO43561 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LATO43561 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LATO43561 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LATO43561 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LATO43561 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LATO43561 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LATO43561 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LATO43561 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LATO43561 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LATO43561 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LATO43561 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LATO43561 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LATO43561 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LATO43561 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LATO43561 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LATO43561 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LATO43561 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LATO43561 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LATO43561 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LATO43561 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LATO43561 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LATO43561 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LATO43561 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LATO43561 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LATO43561 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LATO43561 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LATO43561 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LATO43561 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LATO43561 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LATO43561 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LATO43561 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LATO43561 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LATO43561 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LATO43561 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LATO43561 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LATO43561 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LATO43561 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LATO43561 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LATO43561 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LATO43561 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LATO43561 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LATO43561 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LATO43561 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LATO43561 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LATO43561 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LATO43561 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LATO43561 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LATO43561 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LATO43561 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LATO43561 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LATO43561 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LATO43561 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LATO43561 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LATO43561 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LATO43561 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LATO43561 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LATO43561 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LATO43561 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LATO43561 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LATO43561 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LATO43561 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LATO43561 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LATO43561 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LATO43561 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LATO43561 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LATO43561 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LATO43561 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LATO43561 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LATO43561 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LATO43561 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LATO43561 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LATO43561 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LATO43561 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LATO43561 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LATO43561 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LATO43561 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LATO43561 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LATO43561 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LATO43561 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LATO43561 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LATO43561 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LATO43561 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LATO43561 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LATO43561 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LATO43561 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LATO43561 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LATO43561 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms