Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBX1O43435 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBX1O43435 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBX1O43435 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBX1O43435 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBX1O43435 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBX1O43435 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBX1O43435 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBX1O43435 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBX1O43435 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBX1O43435 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBX1O43435 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBX1O43435 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBX1O43435 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBX1O43435 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBX1O43435 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBX1O43435 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBX1O43435 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBX1O43435 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBX1O43435 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBX1O43435 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBX1O43435 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBX1O43435 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBX1O43435 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBX1O43435 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBX1O43435 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TBX1O43435 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBX1O43435 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TBX1O43435 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TBX1O43435 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TBX1O43435 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TBX1O43435 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TBX1O43435 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TBX1O43435 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TBX1O43435 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBX1O43435 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBX1O43435 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TBX1O43435 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TBX1O43435 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TBX1O43435 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TBX1O43435 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TBX1O43435 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TBX1O43435 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TBX1O43435 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TBX1O43435 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TBX1O43435 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TBX1O43435 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TBX1O43435 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TBX1O43435 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TBX1O43435 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TBX1O43435 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX1O43435 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX1O43435 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX1O43435 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX1O43435 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX1O43435 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX1O43435 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX1O43435 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX1O43435 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX1O43435 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX1O43435 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TBX1O43435 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBX1O43435 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBX1O43435 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TBX1O43435 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TBX1O43435 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TBX1O43435 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TBX1O43435 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TBX1O43435 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TBX1O43435 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TBX1O43435 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBX1O43435 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBX1O43435 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBX1O43435 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBX1O43435 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBX1O43435 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBX1O43435 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBX1O43435 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TBX1O43435 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TBX1O43435 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TBX1O43435 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TBX1O43435 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TBX1O43435 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TBX1O43435 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TBX1O43435 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBX1O43435 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBX1O43435 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBX1O43435 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBX1O43435 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBX1O43435 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TBX1O43435 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBX1O43435 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBX1O43435 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBX1O43435 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBX1O43435 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBX1O43435 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBX1O43435 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBX1O43435 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TBX1O43435 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TBX1O43435 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 264 ms