Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COCHO43405 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COCHO43405 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COCHO43405 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COCHO43405 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COCHO43405 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COCHO43405 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COCHO43405 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COCHO43405 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COCHO43405 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COCHO43405 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COCHO43405 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COCHO43405 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COCHO43405 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COCHO43405 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COCHO43405 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COCHO43405 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COCHO43405 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COCHO43405 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COCHO43405 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COCHO43405 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COCHO43405 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COCHO43405 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COCHO43405 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COCHO43405 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COCHO43405 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COCHO43405 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COCHO43405 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COCHO43405 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COCHO43405 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COCHO43405 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COCHO43405 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COCHO43405 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COCHO43405 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COCHO43405 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COCHO43405 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COCHO43405 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
COCHO43405 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COCHO43405 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COCHO43405 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COCHO43405 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COCHO43405 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COCHO43405 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COCHO43405 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COCHO43405 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COCHO43405 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COCHO43405 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COCHO43405 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COCHO43405 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COCHO43405 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
COCHO43405 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COCHO43405 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COCHO43405 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COCHO43405 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COCHO43405 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COCHO43405 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COCHO43405 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COCHO43405 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COCHO43405 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
COCHO43405 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COCHO43405 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COCHO43405 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COCHO43405 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COCHO43405 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COCHO43405 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COCHO43405 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COCHO43405 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COCHO43405 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COCHO43405 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COCHO43405 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COCHO43405 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COCHO43405 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COCHO43405 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COCHO43405 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COCHO43405 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COCHO43405 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COCHO43405 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COCHO43405 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COCHO43405 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COCHO43405 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COCHO43405 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COCHO43405 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COCHO43405 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COCHO43405 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COCHO43405 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COCHO43405 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COCHO43405 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COCHO43405 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COCHO43405 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COCHO43405 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COCHO43405 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COCHO43405 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COCHO43405 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COCHO43405 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COCHO43405 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
COCHO43405 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COCHO43405 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COCHO43405 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COCHO43405 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
COCHO43405 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251.1 ms