Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSI1O43347 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSI1O43347 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSI1O43347 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSI1O43347 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSI1O43347 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSI1O43347 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSI1O43347 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSI1O43347 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MSI1O43347 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSI1O43347 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSI1O43347 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSI1O43347 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSI1O43347 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSI1O43347 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSI1O43347 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSI1O43347 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSI1O43347 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSI1O43347 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSI1O43347 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSI1O43347 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSI1O43347 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSI1O43347 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSI1O43347 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSI1O43347 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSI1O43347 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSI1O43347 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSI1O43347 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSI1O43347 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSI1O43347 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSI1O43347 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSI1O43347 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSI1O43347 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSI1O43347 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSI1O43347 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSI1O43347 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSI1O43347 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSI1O43347 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSI1O43347 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSI1O43347 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSI1O43347 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSI1O43347 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSI1O43347 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSI1O43347 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSI1O43347 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSI1O43347 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSI1O43347 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSI1O43347 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSI1O43347 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSI1O43347 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSI1O43347 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSI1O43347 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSI1O43347 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSI1O43347 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSI1O43347 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSI1O43347 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSI1O43347 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSI1O43347 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSI1O43347 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSI1O43347 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSI1O43347 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSI1O43347 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSI1O43347 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSI1O43347 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSI1O43347 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MSI1O43347 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MSI1O43347 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MSI1O43347 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MSI1O43347 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MSI1O43347 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSI1O43347 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSI1O43347 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSI1O43347 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSI1O43347 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSI1O43347 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MSI1O43347 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSI1O43347 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSI1O43347 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSI1O43347 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSI1O43347 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSI1O43347 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSI1O43347 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSI1O43347 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSI1O43347 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSI1O43347 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSI1O43347 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSI1O43347 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSI1O43347 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSI1O43347 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSI1O43347 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSI1O43347 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSI1O43347 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSI1O43347 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSI1O43347 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSI1O43347 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSI1O43347 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSI1O43347 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSI1O43347 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSI1O43347 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSI1O43347 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms