Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTIFO43310 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTIFO43310 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTIFO43310 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTIFO43310 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTIFO43310 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CTIFO43310 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTIFO43310 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTIFO43310 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTIFO43310 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTIFO43310 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTIFO43310 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTIFO43310 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTIFO43310 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTIFO43310 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTIFO43310 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTIFO43310 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTIFO43310 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTIFO43310 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTIFO43310 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTIFO43310 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTIFO43310 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTIFO43310 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTIFO43310 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTIFO43310 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTIFO43310 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTIFO43310 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTIFO43310 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTIFO43310 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTIFO43310 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTIFO43310 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTIFO43310 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTIFO43310 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTIFO43310 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTIFO43310 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTIFO43310 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTIFO43310 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTIFO43310 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTIFO43310 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTIFO43310 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTIFO43310 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTIFO43310 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTIFO43310 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTIFO43310 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTIFO43310 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTIFO43310 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTIFO43310 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTIFO43310 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTIFO43310 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTIFO43310 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTIFO43310 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTIFO43310 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTIFO43310 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTIFO43310 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTIFO43310 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTIFO43310 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTIFO43310 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTIFO43310 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTIFO43310 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTIFO43310 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTIFO43310 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTIFO43310 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTIFO43310 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTIFO43310 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTIFO43310 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTIFO43310 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTIFO43310 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTIFO43310 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTIFO43310 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTIFO43310 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTIFO43310 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTIFO43310 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTIFO43310 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTIFO43310 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTIFO43310 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTIFO43310 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTIFO43310 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTIFO43310 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTIFO43310 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTIFO43310 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTIFO43310 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTIFO43310 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTIFO43310 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTIFO43310 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTIFO43310 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTIFO43310 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTIFO43310 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTIFO43310 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTIFO43310 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTIFO43310 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTIFO43310 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTIFO43310 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTIFO43310 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CTIFO43310 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTIFO43310 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTIFO43310 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CTIFO43310 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTIFO43310 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CTIFO43310 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTIFO43310 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
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