Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIPA1L1O43166 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIPA1L1O43166 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SIPA1L1O43166 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms