Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA5O15230 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA5O15230 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA5O15230 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms