Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1CO15160 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1CO15160 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1CO15160 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1CO15160 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms