Protein–RNA interactions for Protein: O15055

PER2, Period circadian protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER2O15055 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PER2O15055 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PER2O15055 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PER2O15055 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PER2O15055 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PER2O15055 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PER2O15055 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PER2O15055 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PER2O15055 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PER2O15055 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PER2O15055 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PER2O15055 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PER2O15055 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PER2O15055 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PER2O15055 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PER2O15055 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PER2O15055 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PER2O15055 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PER2O15055 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PER2O15055 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PER2O15055 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PER2O15055 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PER2O15055 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PER2O15055 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PER2O15055 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PER2O15055 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PER2O15055 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PER2O15055 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PER2O15055 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PER2O15055 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PER2O15055 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PER2O15055 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PER2O15055 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PER2O15055 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PER2O15055 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PER2O15055 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PER2O15055 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PER2O15055 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PER2O15055 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PER2O15055 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PER2O15055 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PER2O15055 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PER2O15055 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PER2O15055 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PER2O15055 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PER2O15055 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PER2O15055 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PER2O15055 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PER2O15055 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PER2O15055 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PER2O15055 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PER2O15055 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PER2O15055 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PER2O15055 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PER2O15055 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PER2O15055 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PER2O15055 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PER2O15055 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PER2O15055 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PER2O15055 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PER2O15055 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PER2O15055 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PER2O15055 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PER2O15055 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PER2O15055 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PER2O15055 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PER2O15055 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PER2O15055 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PER2O15055 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PER2O15055 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PER2O15055 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PER2O15055 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PER2O15055 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PER2O15055 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PER2O15055 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PER2O15055 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PER2O15055 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PER2O15055 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PER2O15055 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PER2O15055 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PER2O15055 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PER2O15055 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PER2O15055 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PER2O15055 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PER2O15055 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PER2O15055 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PER2O15055 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PER2O15055 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PER2O15055 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PER2O15055 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PER2O15055 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PER2O15055 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PER2O15055 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PER2O15055 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PER2O15055 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PER2O15055 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PER2O15055 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PER2O15055 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PER2O15055 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PER2O15055 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms