Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRF6O14896 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRF6O14896 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRF6O14896 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRF6O14896 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRF6O14896 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRF6O14896 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRF6O14896 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRF6O14896 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRF6O14896 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IRF6O14896 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRF6O14896 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRF6O14896 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRF6O14896 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRF6O14896 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRF6O14896 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
IRF6O14896 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IRF6O14896 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IRF6O14896 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IRF6O14896 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
IRF6O14896 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IRF6O14896 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRF6O14896 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRF6O14896 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRF6O14896 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRF6O14896 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRF6O14896 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRF6O14896 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRF6O14896 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRF6O14896 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRF6O14896 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRF6O14896 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRF6O14896 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRF6O14896 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRF6O14896 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRF6O14896 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRF6O14896 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRF6O14896 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRF6O14896 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
IRF6O14896 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
IRF6O14896 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
IRF6O14896 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRF6O14896 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRF6O14896 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRF6O14896 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRF6O14896 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRF6O14896 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IRF6O14896 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRF6O14896 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRF6O14896 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
IRF6O14896 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRF6O14896 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRF6O14896 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRF6O14896 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRF6O14896 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRF6O14896 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRF6O14896 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRF6O14896 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRF6O14896 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRF6O14896 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRF6O14896 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRF6O14896 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRF6O14896 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRF6O14896 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRF6O14896 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRF6O14896 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRF6O14896 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
IRF6O14896 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRF6O14896 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRF6O14896 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRF6O14896 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRF6O14896 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRF6O14896 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRF6O14896 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IRF6O14896 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IRF6O14896 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRF6O14896 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IRF6O14896 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRF6O14896 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRF6O14896 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRF6O14896 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRF6O14896 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRF6O14896 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRF6O14896 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRF6O14896 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRF6O14896 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRF6O14896 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRF6O14896 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRF6O14896 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRF6O14896 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRF6O14896 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRF6O14896 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRF6O14896 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRF6O14896 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRF6O14896 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRF6O14896 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRF6O14896 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRF6O14896 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRF6O14896 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRF6O14896 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms