Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2AO14813 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2AO14813 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2AO14813 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms