Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F3O00716 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F3O00716 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F3O00716 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F3O00716 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F3O00716 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F3O00716 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F3O00716 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F3O00716 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F3O00716 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F3O00716 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F3O00716 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F3O00716 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F3O00716 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F3O00716 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F3O00716 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F3O00716 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F3O00716 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F3O00716 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F3O00716 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F3O00716 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F3O00716 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F3O00716 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F3O00716 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F3O00716 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
E2F3O00716 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
E2F3O00716 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F3O00716 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F3O00716 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F3O00716 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F3O00716 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F3O00716 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F3O00716 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F3O00716 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F3O00716 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F3O00716 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F3O00716 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F3O00716 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F3O00716 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F3O00716 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F3O00716 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F3O00716 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E2F3O00716 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E2F3O00716 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F3O00716 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F3O00716 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F3O00716 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F3O00716 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F3O00716 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E2F3O00716 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F3O00716 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F3O00716 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F3O00716 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F3O00716 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F3O00716 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E2F3O00716 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F3O00716 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F3O00716 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F3O00716 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F3O00716 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E2F3O00716 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F3O00716 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F3O00716 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F3O00716 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F3O00716 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F3O00716 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F3O00716 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E2F3O00716 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F3O00716 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F3O00716 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F3O00716 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F3O00716 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F3O00716 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F3O00716 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F3O00716 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F3O00716 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F3O00716 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
E2F3O00716 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F3O00716 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F3O00716 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F3O00716 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F3O00716 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F3O00716 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F3O00716 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F3O00716 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F3O00716 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F3O00716 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F3O00716 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F3O00716 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F3O00716 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F3O00716 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F3O00716 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F3O00716 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F3O00716 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F3O00716 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F3O00716 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F3O00716 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F3O00716 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F3O00716 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F3O00716 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms