Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DFFAO00273 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DFFAO00273 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DFFAO00273 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DFFAO00273 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DFFAO00273 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DFFAO00273 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DFFAO00273 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DFFAO00273 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DFFAO00273 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DFFAO00273 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DFFAO00273 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DFFAO00273 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DFFAO00273 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DFFAO00273 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DFFAO00273 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DFFAO00273 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DFFAO00273 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DFFAO00273 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DFFAO00273 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DFFAO00273 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DFFAO00273 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DFFAO00273 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DFFAO00273 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DFFAO00273 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DFFAO00273 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DFFAO00273 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DFFAO00273 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DFFAO00273 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DFFAO00273 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DFFAO00273 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DFFAO00273 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DFFAO00273 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DFFAO00273 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DFFAO00273 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DFFAO00273 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DFFAO00273 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DFFAO00273 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DFFAO00273 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DFFAO00273 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DFFAO00273 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DFFAO00273 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DFFAO00273 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DFFAO00273 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DFFAO00273 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DFFAO00273 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DFFAO00273 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DFFAO00273 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DFFAO00273 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DFFAO00273 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DFFAO00273 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DFFAO00273 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DFFAO00273 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DFFAO00273 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DFFAO00273 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DFFAO00273 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DFFAO00273 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DFFAO00273 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DFFAO00273 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DFFAO00273 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DFFAO00273 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DFFAO00273 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DFFAO00273 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DFFAO00273 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DFFAO00273 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DFFAO00273 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DFFAO00273 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DFFAO00273 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DFFAO00273 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DFFAO00273 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DFFAO00273 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DFFAO00273 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DFFAO00273 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DFFAO00273 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DFFAO00273 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DFFAO00273 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DFFAO00273 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DFFAO00273 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DFFAO00273 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DFFAO00273 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DFFAO00273 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DFFAO00273 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DFFAO00273 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DFFAO00273 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DFFAO00273 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DFFAO00273 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DFFAO00273 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DFFAO00273 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DFFAO00273 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DFFAO00273 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DFFAO00273 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DFFAO00273 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DFFAO00273 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DFFAO00273 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DFFAO00273 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DFFAO00273 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DFFAO00273 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DFFAO00273 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DFFAO00273 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DFFAO00273 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms