Protein–RNA interactions for Protein: O00255

MEN1, Menin, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEN1O00255 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEN1O00255 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEN1O00255 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEN1O00255 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEN1O00255 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEN1O00255 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEN1O00255 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEN1O00255 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MEN1O00255 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MEN1O00255 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MEN1O00255 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEN1O00255 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEN1O00255 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEN1O00255 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEN1O00255 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEN1O00255 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEN1O00255 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEN1O00255 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MEN1O00255 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEN1O00255 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEN1O00255 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEN1O00255 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEN1O00255 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEN1O00255 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEN1O00255 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEN1O00255 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEN1O00255 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEN1O00255 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MEN1O00255 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEN1O00255 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEN1O00255 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEN1O00255 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEN1O00255 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEN1O00255 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEN1O00255 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEN1O00255 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEN1O00255 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEN1O00255 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEN1O00255 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MEN1O00255 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEN1O00255 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEN1O00255 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEN1O00255 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEN1O00255 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEN1O00255 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEN1O00255 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEN1O00255 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEN1O00255 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MEN1O00255 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEN1O00255 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MEN1O00255 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MEN1O00255 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEN1O00255 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEN1O00255 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEN1O00255 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEN1O00255 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEN1O00255 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEN1O00255 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEN1O00255 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEN1O00255 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MEN1O00255 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEN1O00255 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEN1O00255 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEN1O00255 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEN1O00255 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEN1O00255 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEN1O00255 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEN1O00255 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEN1O00255 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEN1O00255 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MEN1O00255 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MEN1O00255 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEN1O00255 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEN1O00255 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEN1O00255 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEN1O00255 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEN1O00255 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEN1O00255 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEN1O00255 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEN1O00255 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEN1O00255 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEN1O00255 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEN1O00255 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MEN1O00255 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MEN1O00255 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MEN1O00255 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MEN1O00255 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MEN1O00255 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MEN1O00255 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEN1O00255 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEN1O00255 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEN1O00255 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MEN1O00255 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MEN1O00255 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEN1O00255 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEN1O00255 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEN1O00255 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEN1O00255 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEN1O00255 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MEN1O00255 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms