Protein–RNA interactions for Protein: O00160

MYO1F, Unconventional myosin-If, humanhuman

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1FO00160 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYO1FO00160 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYO1FO00160 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MYO1FO00160 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms