Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBXN8O00124 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN8O00124 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms