Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMX2-CTNND1H3BSU7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMX2-CTNND1H3BSU7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms